O ecrã superior das consolas Nintendo 3DS, Nintendo 3DS XL, New Nintendo 3DS e New Nintendo 3DS XL, apresenta gráficos em 3D, conferindo às imagens dos jogos uma grande profundidade sem a necessidade de óculos especiais.

Através do Regulador de 3D, o efeito 3D pode ser aumentado ou diminuído, consoante a preferência de cada utilizador. No entanto, as imagens em 3D não são recomendadas para crianças com seis anos ou menos de idade. O acesso ao efeito 3D pode ser restringido através da configuração da respetiva definição de Controlo Parental.

Para crianças menores de seis anos, a Nintendo 2DS poderá ser a opção mais apropriada, uma vez que não apresenta imagens em 3D. Todos os jogos lançados para a Nintendo 3DS, porém, são compatíveis com títulos para a Nintendo 3DS no modo 2D.