As aplicações e os títulos do serviço Consola Virtual descarregados ficarão guardados no Cartão SD ao passo que o Nintendo DSiWare descarregado ficará guardado na memória da consola.

É possível mover Nintendo DSiWare para um Cartão SD e vice-versa mas não é possível executar um título Nintendo DSiWare a partir do próprio cartão. Para moveres títulos Nintendo DSiWare, acede a "Definições da Consola" e seleciona "Gestão de Dados". Seleciona "Nintendo DSiWare" e segue as instruções.

Nota que não é possível executar software guardado num Cartão SD noutra Nintendo 3DS; só pode ser executado na Nintendo 3DS na qual o guardaste.